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自治区疾控中心返回的第一批检测报告中，还包含了家畜的检测结果。早期调查组对M村的21只牧羊犬、27只羊、18头牛，采血，进行鼠疫血清学监测，结果：21只牧羊犬中，11只为阳性，阳性率为52.4%，牛和羊均为阴性。
对首例病人丹增宰杀的山羊皮，做反向血凝实验，滴度为1:100，达到阳性标准。
结合现场简易实验的结果，以及自治区疾控中心返回的第一批检测报告，专家组确认，此次M村事件为肺鼠疫爆发，爆发的原因为当地旱獭间疫情严重，而波及人间出现肺鼠疫病人，然后通过人与人的接触传播，引起该地肺鼠疫爆发。
确定为肺鼠疫爆发后，南之乔建议，对M村通往外界的交通，各种途径通往县城的交通、县城通往市的交通路段实施封锁，设立交通简易站。
由于本次疫情为肺鼠疫，疫情发展快，病死率高，又出现病人私自外出情况，根据鼠疫控制预案，为了有效控制疫情扩散，要对疫区进行封锁。
L县县长担任现场疫情调查处理指挥部的指挥长，向市政府呈报，经自治区政府批准，对疫区实施了封锁，当地公安和武警具体执行封锁任务。
严格封锁后的疫区，除进行疫情调查处理的工作人员外，任何行人、车辆、马匹等，不能进入M村，M村任何人、畜、物不能出村。
疫区10公里内的交通要道，设置了交通检疫，对过往的行人、乘客、司机、售票员测量体温，对车辆进行消毒，严格往外运送牛、羊、狗、旱獭等牧区动物。
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在调查组做出封锁检疫的严格安排之后，达娃的丈夫――尼玛，到达L县城，前往L县医院就诊。
县医院的医生询问尼玛的来源地和临床表现，发现是M村不明原因死亡事件的病例之一，于是，立即隔离了尼玛，同时报告L县疾病预防控制中心。
L县疾控中心的人立即赶到县医院，进行流行病学调查，同时采集尼玛的血液和血痰等标本，送自治区疾控中心实验室进行检测。
据尼玛自己交代，当天晚上离开M村后，他先骑马到G乡，然后自己开车赶往L县城，途中有三名熟人陪伴，先后居住在8户牧民家里，自身携带的物品和衣服放在多位农牧民家中。
L县疾控中心的人，根据尼玛的叙述，调查尼玛从M村到L县途中接触过的人群，最后发现，直接接触者有111人。
对这些尼玛的直接接触者，当地卫生部门立即对他们进行9天的医学观察。
有了尼玛的下落，M村的疫情控制也告一段落，南之乔、叶蓁蓁、老赵和多吉，现场调查组的一部分人员，离开M村，来到L县县城。
在查看了L县医院及尼玛的情况后，南之乔建议，由于县医院门诊量大，没有一个相对对立的区域隔离肺鼠疫病人，需要将尼玛转送到离县城最近的乡卫生院，因为那里相对独立，便于隔离。
为了防止转运过程中出现差错，南之乔和蓁蓁亲自跟随。
转移之前，南之乔亲自示范了防护装... -->>
